Насчитывает 294 чучела пресноводных и морских рыб, а также костный материал, в основном, по хрящевым рыбам. Коллекция не собиралась целенаправленно, а складывалась из эпизодических поступлений из разных источников, в последнее время по большей части из аквариума Московского зоопарка и зоообъединения Террариум-центр. Большинство экспонатов данной коллекции использовано при строительстве новой экспозиции музея, в частности в диораме «Коралловый риф».
Несомненный интерес представляет серия из двадцати шести рострумов различных видов пил-рыб (обыкновенная, зеленая, малозубая и другие) разной величины, наглядно иллюстрирующая внутривидовую и возрастную изменчивость, а также челюсти различных видов акул (тигровая, длиннокрылая, атлантическая песчаная) и скатов. Эти материалы в свое время были приобретены у фирмы Умляуф (г. Гамбург, Германия). Кроме того, коллекция содержит неплохую подборку чучел рыб-кузовков и рыб-ежей (иглобрюхов).